今から凡そ1250年前、聖武天皇の御代、天平宝字元年（757年）に、日光山を開いた勝道上人（しょうどうしょうにん）によって当山奥之院三昧石（三枚石）が開創されました。
金剛山という名称は、弘法大師が上人の遺弟道珍法師に金剛界の大法を授けた説と、建武年間（1334―1335）に後醍醐天皇の勅願によって大和の国（奈良県）葛城別当賢道（けんどう）僧正によって、葛城金剛山の分霊を奉じて本尊金剛童子を祀った説があります。
中古以来日光山発展と共に古峯原も峯修行に多くの修行者来山し、興隆してまいりましたが、明治初年の神仏分離令による政体の変更、大正8年の大洪水による本堂並びに庫裡、客殿の流出等、諸般の事情により、当山も一時哀徴の一途をたどりましたが、先師の努力により、霊域も回復、有縁の浄地を現在地に求めて、堂宇を建立、法燈を護持して今日に至っております。
　　（瑞峯寺サイトより）

日光修験道の瑞峯寺縁起

　夫れ、当山はこれより西方約10キロ海抜1400ｍ山頂に
古峯ヶ原よとゆう霊域大原野あり。其の中央に峨々（かか）
たる大岩窟あり。これ即ち古峯ヶ原金剛山（当山奥之院三昧石）にして、今を去る壱千二百有余年勝道上人32歳の時なり。降臨の金剛大権現（金剛童子尊）を安置し奉つる。本地不動明王なり。内心に慈悲深重をたたえ、外相には悪魔降伏念怒の威厳を現せり。かるか故に火難盗難全ての災難を未然に払い、家内安全　福徳円満等最大の利益を授けたまう。特に火防の霊尊として、霊験顕著なり。勝道上人の道弟道珍法師に峯中法流の大法を授けて　この霊地を修験の根本道場とす。後ち、後醍醐帝勅願により大和国葛城別当賢道僧正、建武年間、葛城金剛山の分霊を奉じて、古峯ヶ原の峯に修行す。故に当山の、金剛山と称する真実因なり。
爾来、連綿と続けし、修験の法燈も、明治初年の政体の変更且つまた大正8年大洪水による、本堂及び境内地の流出等諸般の事情により、当山も、時衰退微の一途をたどりしも、先師の努力にて、堂宇も、建立、法燈を護持して今日に至る。
金剛山々主　清源記す
水戸松苑